U-Path

Undetected-aware enrichment software (pathway / set analysis)
エンリッチメント解析ソフトウェア開発

U-Path

U-Path は、検出されない代謝物(undetected / non-detectable)を前提に、 エンリッチメント解析(pathway / set analysis)を「再現可能に」実行できるソフトウェア群として開発しています。 現在はその一部として、Rパッケージ mseapca を公開しています。

Undetected-aware Background explicit MSEA / ORA SSEA GSEA-style
ご相談: サポート、Python実装、GUI開発、データベース整備のご相談はこちらまで。 連絡先 h.yama2396@gmail.com
※ 簡単に「目的/データ種類/運用形態(CLI/GUI/MCP)」を書いていただけると助かります。

Rパッケージ:mseapca(U-Pathの一部)

mseapca は、メタボロミクスを主対象としたエンリッチメント解析Rパッケージです。 MSEA(ORA)、SSEA、GSEA-style解析に対応し、未検出を考慮した拡張も含みます。

install.packages("mseapca")

詳細(使い方・vignette・検証)は、CRAN / GitHub / ドキュメントにまとめる想定です。

今後の予定

  • Python実装:企業・解析基盤への組み込み(wheel / CLI / API)
  • GUI:ローカルGUI(入力 → 実行 → レポート出力)
  • データベース:セット定義の整備、更新・配布の仕組み
  • MCP対応:AIエージェント連携(安全な呼び出し・ログ設計)
  • サポート:導入・運用・解析設計の技術支援(企業・研究機関向け)

※ Python版やGUIは、公開形態や名称を含めて検討中です(mseapcaとは別名にする可能性があります)。